قرر حاكم التحقيق بالمكتب الثالث بالمحكمة العسكرية الدائمة بتونس رفض الإفراج عن سيف الدين مخلوف وذلك في القضية التى اتهم فيها بالمس من معنويات الجيش إثر خلاف جد بينه وبين أحد القضاة العسكريين بمقر المحكمة واتهام الجيش بالانقلاب .

هذا وأصدر قاضي التحقيق العسكري بطاقة إيداع بالسجن في حق سيف الدين مخلوف فيما عرف بقضية غزوة المطار، كما تعلقت بمخلوف أيضا قضية منشورة لدى قاضي التحقيق بالمحكمة الابتداىية بالقصرين تعلقت بتدليس العملة، وقضية رفعها عليه وكيل الجمهورية بالمحكمة الإبتدائية بسيدي بوزيد من أجل الإساءة له عبر شبكات التواصل الاجتماعي فايس بوك أثر إصداره لبطاقات إيداع بالسجن فيما عرف بقضية المدرسة القرأنية بالرقاب التى تم فيها كشف ممارسات فظيعة في حق التلاميذ وصلت الى حد اجبارهم على آكل الديدان وضربهم بدعوى تعليمهم كيفية الجهاد كما كشفت الابحاث ايضا تعرض البعض منهم لاعتداءات جنسية من قبل مدرس المدرسة وتم الحكم عليه ب30 سنة سجنا بعد ثبوت ادانته كما تبين أنه تمت دمغجة الاطفال وحثهم على الجهاد فيما تبين أن صاحب المدرسة متزوج عرفيا من مدرسة تعمل هناك.